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   日期:2021-07-30     浏览:    评论:0    
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一是在可能接触病人或病毒污染的场所,要注意做好个人防护和个人卫生,佩戴符合要求的个人防护装备,如医用外科口罩。 二是注意不要聚集,少到密闭、通风不良的公共场所,减少与公共部位的接触,回家后及时洗手…

1998年,吉林大学考古系与生命科学学院合作开展了有关古DNA方面的研究工作,中国第一座█古DNA实验室█落成。随着DNA考古研究的逐步深入,古DNA实验室已初步建立了我国边疆地区的古代DNA基因库,已有超过万例的古人类、古动植物样本,数量位居全国第一,为古DNA研究提供了强有力的资源支持。。

古DNA的研究中,研究人员先对骨骼样本进行采集,用专业工具获得骨骼粉末;采用特有的试剂盒对粉末进行DNA提取;随后对提取液中的古DNA进行文库的构建并测序。通过测序仪测得DNA片段的序列信息后,首先比对(Mapping)至所研究物种的参考基因组(References), 然后利用群体遗传学分析工具、系统发育软件等对序列信息进行分析,并与现代或者其他古代人群、动物等遗传信息进行比对,从而追溯个体或群体的来源、迁移以及融合过程等。

无论是比对(Mapping)、群体遗传学分析、还是系统发育分析,这些研究数据的处理都对背后的算力提出了要求。过去,科研人员通常使用台式机和普通的服务器进行一系列数据分析,单次能分析的序列数量非常有限;随着高通量测序技术平台的开发应用,对小片段古DNA分子捕获能力的加强,古DNA研究走出了单纯依靠线粒体基因组及少量核基因的时代,在数据量方面的重要突破打破了过往数据匮乏的研究瓶颈。然而,随之而来的是对大规模DNA数据处理的巨大计算需求。

█用台式工作站做古DNA的测序数据处理,一般完成一次古人类的全基因组样本分析需要耗时至少两周,过程中还要面临宕机带来的处理流程中断风险。按这种效率,我们要建立边疆地区古代DNA基因库几乎是一个不可能完成的任务。█吉林大学边疆考古研究中心副主任蔡大伟教授表示。

浪潮为解决这一难题提供了新思路,作为中国AI计算的领军企业,浪潮专门为基因测序开发了FPGA加速计算方案,FPGA具有可编程、并行计算、低延迟的优势,能够为基因测序、语音识别、视频处理、风险管理等AI和HPC场景提供强大的加速。经过严苛测试和全面考察,吉林大学考古学院决定和浪潮合作,将FPGA技术运用到古DNA基因测序中,打造我国DNA考古领域的首个FPGA基因测序加速应用方案。

测试显示,搭载浪潮FPGA基因测序加速计算方案可在9.64 小时内完成全基因组分析,48分钟完成全外显子组分析,相比基于CPU的方案,基因数据处理速度提升39倍。处理能力在国内处于领先水平。

如今,吉林大学考古DNA实验室的科研工作者正在充分借助智算解决方案,对我国北方地区的草原游牧民族,如匈奴、东胡、鲜卑、乌桓、契丹、蒙古等诸族的人骨以及出土的动植物进行古DNA的提取和研究工作,并开展我国新疆地区古代█丝绸之路█沿线各民族相互关系、人群间的迁徙及混杂过程、经济文化生活、自然环境与人类相互关系等相关研究。也许在不久的将来,人类就能够寻找到█我是谁,我从哪里来,我要去哪里█这三个终极问题的准确答案。



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